- Relatórios TécnicosCETESB, São Paulo 1985. Operação Marina. Relatório de atendimento. CETESB, São Paulo.
_________ 1988. Operação Tebar III. Relatório de atendimento. CETESB São Paulo.
_________ 1989. Estabelecimento de padrões estruturais de comunidade de costões rochosos: bases para gerenciamento. Relatório Técnico. São Paulo, CETESB. 7 p., 80 figs., 88 tabs.
_________ 1990. Levantamento de subsídios e instrumentação para o gerenciamento de áreas costeiras ecologicamente sensíveis – Informe Final. São Paulo, CETESB/OEA.
_________ 1991. Operação Penélope, Relatório Final. Revisão 1. São Paulo, CETESB, 106p.
_________ 1991. Operação Katina P, Relatório Final. São Paulo, CETESB, 47p.
_________ 1994. Operação Tebar V, Relatório de Atendimentos. São Paulo, CETESB. 45p. + anexos.
_________ 1997. Operação Bagé. Relatório de atendimento. CETESB, São Paulo.
_________ 1998. Operação Smyrni, Relatório Técnico. São Paulo, CETESB, 112p.
_________ 1998. Operação Maruim. São Paulo, CETESB, 97p.
_________ 1999. Operação Tebar VI. São Paulo, CETESB, 18p. + anexos.
_________ 2000. Operação Mafra. São Paulo, CETESB, 26p. + anexos
_________ 2001. Operação Vergina II. São Paulo, CETESB, 39p. + anexos.
_________ 2001. Operação OPASA. São Paulo, CETESB, 15p. + anexos.
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MILANELLI, J.C.C.; LOPES, C.F. & JOHNSCHER-FORNASARO, G. 1991.Estudo de metodologias para a recuperação de costões rochosos impactados por óleo. São Paulo, CETESB, Relatório Técnico. 28p.
MILANELLI, J.C.C.; LOPES, C.F. & JOHNSCHER-FORNASARO, G. 1993.Estudo de metodologias para a recuperação de costões rochosos impactados por óleo. São Paulo, CETESB, Relatório Final. 45p.+anexos.
MILANELLI, et al. 1997. Desenvolvimento de metodologias para diagnóstico, monitoramento e recuperação ambiental de ecossistemas costeiros. Relatório de atividades- 1995. São Paulo, CETESB, 49p+anexos.
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Trabalhos Científicos
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SECRETARIA DO MEIO AMBIENTE / PROBIO-SP Conhecer para Conservar: as unidades de conservação do Estado de São Paulo. Secretaria de Estado do Meio Ambiente. Editora Terra Virgem. 115p. 1999.
- Livros
LAMPARELLI, C.C.; MOURA, D.O.; VINCENT, R.C.; RODRIGUES, F.O.; LOPES, C.F. & MILANELLI, J.C.C. 1998. Mapeamento dos ecossistemas costeiros do estado de São Paulo. São Paulo: Secretaria do Meio Ambiente. CETESB. 108p.Lopes, C.F.; Milanelli, J.C.C; Poffo, I.R.F. Ambientes costeiros contaminados por óleo: procedimentos de limpeza – manual de orientação. São Paulo: Secretaria de Estado do Meio Ambiente, 2007. 120p.
- Dissertações de Mestrado
LOPES, C.F. 1997. Monitoramento das populações de Chthamalus spp. (Crustacea – Cirripedia) de costões da área do Canal de São Sebastião – SP: Instrumento para a avaliação dos efeitos biológicos provocados por um derrame de petróleo. Dissertação de Mestrado. Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo. 87p + tabelas e figuras.
MILANELLI, J.C.C. Efeitos do petróleo e da limpeza por jateamento em um costão rochoso da praia de Barequeçaba, São Sebastião, S.P. Dissertação de Mestrado. Instituto Oceanográfico da Universidade de São Paulo. 2 vol. 1994.Poffo, I.R.F. 2000. Vazamentos de Óleo no Litoral Norte do Estado de São Paulo. Análise Histórica (1974-1999). Dissertação de Mestrado. PROCAM/USP – Programa de Pós- graduação em Ciências Ambientais da Universidade de São Paulo.Rodrigues, F.O. 1997. Derramamentos de óleo no ecossistema manguezal – Limpeza do ambiente, efeitos e metodologia de estudo. Dissertação de mestrado, Faculdade de Saúde Pública – Departamento de Saúde Ambiental. 175p. + anexos. - Teses de Doutorado
MILANELLI, J.C.C. Biomonitoramento de costões rochosos – instrumento para avaliação de impactos gerados por vazamentos de óleo na região do Canal de São Sebastião – São Paulo. Tese de Doutorado – Instituto Oceanográfico da Universidade de São Paulo. 2003.Poffo, Iris Regina Fernandes. Gerenciamento de riscos socioambientais no complexo portuário de Santos na ótica ecossistêmica. São Paulo, SP. Tese de doutorado. Programa de Ciência Ambiental – PROCAM – USP, 2007.